La notion d'entrepôt par défaut n'existe pas dans PrestaShop, ni dans Store Commander.
Il y a plus simple : des cases à cocher dans la grille 'Entrepôts' de la colonne des Propriétés permettant l'association d'un ou plusieurs produits à un ou plusieurs entrepôts en masse en une seconde.
Vous pouvez également utiliser les icônes d'association en masse sur la barre d'outils après avoir sélectionné les entrepôts.