Vous lancez un export et votre fichier est vide ou le nombre total de produits exportés ne correspond pas ?
Si vous avez cochez l'option 'Exporter par catégorie par défaut', il faudra alors vérifier si la/les catégorie(s) sélectionnée(s) est/sont bien la/les catégorie(s) par défaut des produits qui s'y trouvent.
Référez-vous à cet article pour savoir comment vérifier.